哈尔滨工程大学具有光荣的历史传统，前身是创建于1953年的中国人民解放军军事工程学院（"哈军工"）。1970年，在哈军工原址，以海军工程系全建制及其它各系(部)部分干部教师为基础，组建哈尔滨船舶工程学院，1994年更名为哈尔滨工程大学。1978年，学校被国务院确定为全国重点大学；1982年成为首批具有博士、硕士学位授予权的单位；1996年进入首批"211工程"建设高校行列；2002年由教育部批准设立研究生院；2007年，由国防科工委、教育部、黑龙江省政府、海军四方共建；2011年，学校跻身国家优势学科创新平台重点建设高校。学校现隶属于工业和信息化部。
　　学校占地面积126万平方米，建筑面积82.94万平方米。现设有船舶学院、航建学院、动能学院、自动化学院、水声学院、计算机学院、软件学院、国家保密学院、机电学院、信通学院、经管学院、材化学院、理学院、人文学院、国际学院、继教学院、核学院、马克思主义学院、国防学院、创业教育学院等20个学院，以及外语系、体育部、工训中心等3个教学系、部、中心。学校设有40多个科研机构以及150多个科研和教学实验室，其中国家级重点实验室2个，国家工程实验室1个，教育部重点实验室及工程研究中心5个，国防重点学科实验室2个，省重点实验室及工程研究中心5个，省发改委工程实验室3个；国家级学科创新引智基地3个，国家电工电子教学基地1个，国家级实验教学示范中心4个，国家大学生文化素质教育基地1个，图书馆共有藏书304.46万册。学校现有教职工3183人，其中专任教师1793人。教师中有"两院"院士8人，博士生导师372人。到2014年9月，各类在校研究生8800余人，其中博士研究生1600余人。
　　学校现有一级学科博士点12个，一级学科硕士学位授权27个，二级学科博士学位授权点39个，二级学科硕士点119个，博士后科研流动站和工作站13个，学科专业涉及8个学科门类40个一级学科。轮机工程，水声工程，船舶与海洋结构物设计制造，导航、制导与控制等4个学科为国家重点二级学科，船舶与海洋工程等12个学科（群）为省"十二五"重点学科（群）。
　　学校不仅以国内第一艘实验潜艇、第一艘水翼艇、第一台舰载计算机、第一套条带测深仪等数十项填补国内空白的重大科研成果著称，而且还以双工型潜器、气垫船、梯度声速仪等成果摘取过世界第一的桂冠，已成为我国舰船科学技术基础和应用研究的主力军之一、海军先进技术装备研制的重点单位，是我国发展海洋高技术的一支重要依托力量。学校在船海核领域保持着很强的技术储备，水下机器人、船舶减摇、组合导航、水声定位、核动力仿真等技术居国内领先或国际先进地位。"十五"以来，学校承担国家重大科技攻关、"973计划"、"863计划"等一大批科研项目，获得省部级以上奖励200余项。2013年科技经费8.4亿多元，位居全国重点高校前列。科研产品质量管理通过ISO9000质量体系认证，是国内高校首家通过"双认证"的大学。
　　建校以来，学校为国防系统和国民经济建设培养了7万余名各类高级专门人才，其中包括200多名共和国的将军、部长、省长，2000多名高等院校、科研院所、国防大中型企业的院士、教授、厂长、所长及劳动模范，以及一大批科技和管理精英。
　　61年来,学校坚持和发扬老一辈革命家倡导培育的"哈军工精神"，形成了"大工至善,大学至真"的校训、"忠诚、坚韧、团结、创新"的校风，紧紧抓住"三海一核"领域的国家战略机遇，正在向着特色鲜明的高水平研究型大学目标阔步迈进。