四川音乐学院于1982 年开始招收硕士研究生。1982年至2002年招收音乐学各专业方向硕士研究生，2000年经国务院学位委员会批准成为开展同等学力人员申请硕士学位的学位授予单位，2002年又增招了美术学各专业方向硕士研究生，2005年经国务院学位委员会批准成为首批艺术硕士(MFA)专业学位研究生(音乐领域)招生和培养的试点院校之一，2009年开始与四川大学联合招收培养文学与音乐跨学科研究博士生，2010年首批招收高校在职教师攻读硕士学位研究生。2011年国家对学科门类进行了科学调整，我院于2012年开始招收艺术学理论、音乐与舞蹈学、美术学三个一级学科各专业方向硕士研究生。
　　学院拥有一支高素质、高水平和高研究能力的硕士研究生导师队伍。现有硕士研究生导师205人，其中教授112人，副教授93人，国务院特殊津贴专家12人，省学术和技术带头人10人。汇集了一批高学历、高职称和高研究能力的教授、博士、研究员科研队伍。与四川大学联合培养音乐与文学跨学科研究博士生，副博导6人。
　　研究生教育经过三十余年的发展，逐步在研究生培养、学科建设、导师队伍建设、教育管理等方面取得了一些成绩。研究方向、培养人数都发生了很大的变化，从最初的每年招收1个专业方向1个学生发展到现在的40多个研究方向160余名学生的规模。至今，已向国家培养了566 名硕士研究生。为满足文化大发展大繁荣的需要，培养高层次艺术人才的速度也正在加快，现在校的各种类型的硕士研究生人数达到了532名，联合培养的博士研究生8名，涵盖了艺术学理论、音乐学与舞蹈学和美术学的所有专业方向。