中国科学院新疆理化技术研究所（以下简称新疆理化所），于2002年3月28日，在原中国科学院新疆物理研究所和中国科学院新疆化学研究所（均于1961年成立）的基础上整合成立。
　　新疆理化所定位：围绕国家“一带一路”发展战略，依托丝绸之路经济带核心区优势，面向新疆区域经济发展、中亚科技合作和国家航天与海洋需求，加强维药现代化学科建设，推进维吾尔医药的现代化、标准化、产业化、国际化；加强电子元器件累积辐射效应学科建设，为各类元器件抗累积辐射效应加固和可靠应用提供稳定的服务能力；加强敏感材料与器件学科建设，为我国航天、海洋工程中极端环境探测装备所需的温度传感器提供共性技术支撑，保持优势学科不可替代的地位；加强维哈柯文信息处理学科建设，为新疆长治久安及“一带一路”核心区的信息化建设提供技术支撑。同时，强化中科院向西开放“桥头堡”作用，强化与中亚等国家交流与合作，强化院内合作和学科交叉，培育新的增长点。将研究所建成国内特色鲜明和中亚有影响力的研究机构。
　　新疆理化所设有资源化学、材料物理与化学、多语种信息技术、环境科学与技术4个研究室。建设了维吾尔药活性筛选技术平台、药用植物组培与生物育种平台、特种热压敏研发平台、辐射效应评估技术平台、光电功能材料研发平台、多语种软件测试平台，以及大型仪器分析测试中心、辐照中心、信息情报中心3个技术支撑平台。
　　研究所现有“中国科学院干旱区植物资源化学重点实验室”，“中国科学院特殊环境功能材料与器件重点实验室”，“民族药关键技术及工艺国家地方联合工程研究中心”，省部共建“新疆特有药用资源利用国家重点实验室培育基地”以及“新疆植物资源化学重点实验室”、“新疆电子信息材料与器件重点实验室”、“民族语音语言信息处理实验室”3个省级重点实验室和新疆精细化工工程技术中心；与中亚地区及我国东部有关研究机构共建了“中亚地区可食植物功能成分联合实验室”；与新疆公安消防总队成立了“火灾科学与消防工程合作实验室”。
　　截至2015年底，新疆理化所共有在职职工240人。其中科技人员181人、科技支撑人员30人，包括研究员及正高级工程技术人员42人、副研究员及高级工程技术人员77人。共有“青年千人计划”入选者17人（新增3人），中国科学院“百人计划”入选者15人，“西部之光”人才入选者143人（新增12人）；国家杰出青年科学基金获得者2人，国家级“新世纪百千万人才工程”候选人2名，新疆维吾尔自治区高层次人才计划23人（新增4人）。 新疆理化所是1987年国务院学位委员会批准的硕士学位授予权单位之一，2004年经中国科学院批准增列博士培养点，现设有化学、电子科学与技术两个专业一级学科博士研究生培养点，有机化学、无机化学、物理化学、材料物理与化学、微电子学与固体电子学、物理电子学、计算机应用技术7个二级学科博士培养点；有机化学、无机化学、物理化学、材料物理与化学、微电子学与固体电子学、物理电子学、药物化学、计算机应用技术、计算机技术、材料工程等10个专业二级学科硕士研究生培养点，并设有化学、电子科学与技术2个专业一级学科博士后流动站，共有在学研究生244人（其中硕士生117人、博士生127人），在站博士后20人。
　　2015年，新疆理化所共有在研项目681项（新增项目128项）。其中，承担国家重点基础研究发展计划（973）项目1项、承担（或参加）课题2项；承担国家高技术研究发展计划（863）项目1项、承担（或参加）课题5项（新增1项）；承担国家自然科学基金面上项目22项（新增5项）、国家杰出青年科学基金项目2项、国家自然科学基金国际合作重点项目1项、国家自然科学基金—新疆联合基金15项（新增1项）；承担中国科学院战略性先导科技专项课题2项；承担（或参加）院重点部署课题4项；承担院科研装备研制项目9项（新增2项）；承担院地合作项目12项（新增3项）；承担新疆维吾尔自治区重大专项项目2项、承担（或参加）课题7项。
　　2015年，申请国内发明专利75项、国外发明专利1项，授权国内发明专利57项；发布地方标准9项、国家标准9项；申报并获批准软件著作权15项；发表各类科技论文150篇，其中SCI收录113篇。
　　新疆理化所材料物理与化学研究室“航天海洋测温NTC热敏电阻器的研制及应用团队” 获2015年度中国科学院科技促进发展奖科技贡献奖二等奖。“18种新疆特色药用植物化学成分与生物活性研究”等两项成果获2015年度新疆维吾尔自治区科技进步一等奖。
　　2015年，按照中国科学院“走出去”发展战略和研究所发展的实际需要，全年出访人员48人次，来访47人次，国际合作项目立项20项；在土耳其安塔利亚联合举办了“第十一届天然化合物化学国际研讨会暨丝绸之路医药产业发展战略高峰论坛”，在乌鲁木齐举办了“第一届海峡两岸光电功能材料设计制备前沿研讨会暨新疆青年学术论坛”。
　　“中亚药物研发中心”建设取得新进展，中心颁布了系列管理制度，各项科研合作工作有序进行，在乌兹别克斯坦塔什干拟建的中心成型工艺中试平台、专家公寓等已完成设计、规划等前期手续，2016 年春将开工建设。
　　2015年，研究所面向区域经济社会发展需求，与企业合作更加深入，新疆首个中药五类新药“棉花花总黄酮片”、“棉花花总黄酮”药物临床试验批件成功转让新疆维吾尔药业有限责任公司，目前正在上海曙光医院进行一期临床试验；针对新疆油田与化工工业废水处理的需求，并得到院科发局STS项目支持。第八届“中国科学院—新疆科技合作洽谈会”上展出了研究所15项科研成果和5个科技平台，拓展了成果转移转化的渠道和方式。
　　新疆理化所是物理、化学、自动化、生物化学、核学会等省级学会理事长挂靠单位。